ABI 7500荧光定量PCR仪技术是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,zui后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
1.Ct值的定义
在荧光定量PCR技术中,有一个很重要的概念--Ct值。C代表Cycle,t代表threshold(阈值,临界值),Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数。
2.荧光阈值的设定
PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光阈值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍,即:threshold=10′SDcycle3-15
3.Ct值与起始模板的关系
研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
ABI 7500荧光定量PCR仪是特异性靶基因检测与定量的一体化平台。7500将PCR热循环,荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可以动态观察PCR每一循环各反应管中PCR扩增产物逐渐增加的情况。
定量PCR系统的标准模式采用25-100微升反应体积,可以采用96孔板或单管/8联管进行实验反应。另外7500还可以升级为快速热循环样品基座,该升级为选购件,由AB公司工程师负责安装。快速热循环样品基座采用新型96孔反应板,这种反应板的管内液体上方的空间较小,可以支持5-30微升反应体积的实验。采用样品基座升级后的7500,新型96孔反应板和新型快速热循环定量PCR预混试剂,实时定量PCR实验可以在40分钟内完成,实验效果与标准2小时模式一致。
ABI 7500荧光定量PCR仪应用广泛,包括基于相对定量分析的基因表达分析,以标准曲线为基础的病原体定量分析,定性的PCR扩增后核酸序列的SNP基因型分析,以及以阳性内对照为基础的阳性/阴性结果判定。